Стафилококковые инфекции характеризуются большим разнообразием клинических проявлений, что часто затрудняет диагностику и своевременное начало этиотропного лечения. Нередко инфекция имеет хроническое, длительное течение, реже протекает остро. Стафилококк может быть причиной тяжелых септических процессов (нередко типа септикопиемии с образованием отдельных, но чаще множественных абсцессов в различных органах) и местных (также нередко гнойного характера) поражений в легких, печени, почках, кишках, селезенке, лимфатических узлах, подкожной клетчатке, мозговых оболочках и др.
Для стафилококковой инфекции характерна склонность к метастазированию и частым рецидивам, нередко возникающим после временного улучшения. По сравнению с другими инфекциями стафилококковая болезнь у детей часто характеризуется тяжестью и наклонностью к развитию генерализованных форм. Более тяжело протекающие случаи чаще всего вызываются штаммами стафилококка, устойчивыми к ряду более часто применяемых антибиотиков сульфаниламидов (множественноустойчивые штаммы). В таких случаях больные фактически нередко остаются без этиотропного лечения,
Ухудшение течения стафилококкового процесса часто связано с обострением в результате отравления организма токсинами возбудителя или токсическими продуктами вызываемого им распада тканей.